zpradat:indirect_ordination
Table of Contents
2. Nepřímá ordinace
Cvičení 2.1
- Na datech z třebíčských trávníků (naimportovaných ve cvičení 1.1) vypočtěte DCA (údaje o druzích jsou v procentech pokryvnosti - použijte logaritmickou transformaci).
- Jaká je délka první osy DCA? Podle této délky se rozhodněte, jestli je na data třeba použít lineární nebo unimodální metodu ordinace a tu na datech spočtěte (tedy buď PCA, nebo CA).
- Nakreslete ordinační diagram, ve kterém budou nakresleny druhy a vzorky a který bude vypadat následovně:
- druhů nakreslete jenom cca 20,
- jednotlivé vegetační typy zobrazte různými symboly,
- vypněte zobrazování čísel u ploch,
- k obrázku připojte legendu,
- posuňte popisky u jednotlivých druhů tak, aby se co nejméně navzájem překrývaly a aby překrývaly co nejméně čar.
Cvičení 2.2
- Použijte simulovaná ekologická data, konkrétně soubor simul1-spe-env.xlsx, který obsahuje druhová data nasimulovaná podle ekologického modelu strukturovaného jednou proměnnou prostředí (podrobnosti viz popis dat).
- Do programu Canoco naimportujte druhová data z listu
simul1-spe
. - Použijte data k výpočtu DCA, CA a PCA a nakreslení patřičných ordinačních diagramů (v diagramech nakreslete vzorky bez popisků.
- Jak se jmenují jednotlivé artefakty, které jsou vidět ve výsledných ordinačních diagramech PCA a CA?
zpradat/indirect_ordination.txt · Last modified: 2014/03/27 13:00 (external edit)