User Tools

Site Tools


zpradat:nmds:solution_3.1

Řešení cvičení 3.1

Výpis z programu WinKyst vypadá následovně:

Original data (30 samples; 75 variables) read from a file:
"C:\Users\Zeleny\Downloads\tikus.spe"
Calculated matrix of Bray-Curtis distances.
Initial PCoA configuration found with 20 real axes
Calculating configuration in 2 dimensions
NMDS solution found with 59 iterations, stress = 0.15566
Stress minimum value approached

Attempting 10 perturbation with max amplitude 0.26488

  PERTURBATION  STRESS VALUE
***********************
         1          0.15138  [replacing with this config]
         2          0.17353
         3          0.15033  [replacing with this config]
         4          0.15474
         5          0.15632
         6          0.15566
         7          0.15230
         8          0.15138
         9          0.15475
        10          0.15138

 Final stress is 0.15033

Shepardův diagram (toto je výsledek programu WinKyst - Canoco 5 tento obrázek nenabízí):

Výsledný ordinační diagram (Bray-Curtis distance):

Ordinační diagram NMDS, vypočtené na základě Euklidovské distance:

zpradat/nmds/solution_3.1.txt · Last modified: 2014/03/27 13:00 (external edit)