zpradat:nmds:solution_3.1
Řešení cvičení 3.1
Výpis z programu WinKyst vypadá následovně:
Original data (30 samples; 75 variables) read from a file: "C:\Users\Zeleny\Downloads\tikus.spe" Calculated matrix of Bray-Curtis distances. Initial PCoA configuration found with 20 real axes Calculating configuration in 2 dimensions NMDS solution found with 59 iterations, stress = 0.15566 Stress minimum value approached Attempting 10 perturbation with max amplitude 0.26488 PERTURBATION STRESS VALUE *********************** 1 0.15138 [replacing with this config] 2 0.17353 3 0.15033 [replacing with this config] 4 0.15474 5 0.15632 6 0.15566 7 0.15230 8 0.15138 9 0.15475 10 0.15138 Final stress is 0.15033
Shepardův diagram (toto je výsledek programu WinKyst - Canoco 5 tento obrázek nenabízí):
Výsledný ordinační diagram (Bray-Curtis distance):
Ordinační diagram NMDS, vypočtené na základě Euklidovské distance:
zpradat/nmds/solution_3.1.txt · Last modified: 2014/03/27 13:00 (external edit)